gam1et

Нужно смотреть весь код и экспериментировать. Может получится если правильно настроить z-index у body, fancybox и нужного элемента. То есть боди в минусе, затем +1 у fancybox, а затем +2 у элемента

Да, это абсолютно нормально. CSS пересчитывает графику, тем самым на это время упрощая её. Ну лично я так это представляю Но то что есть искажение текста (и изображения тоже) при анимации это нормально

Используй для этого свойство z-index

Вот здесь почитай, очень подробно расписано http://slaikblog.ru/category/css/css-optim/